• bioMérieux EpiSeq

bioMérieux EpiSeq™ Con la tecnología de Illumina™

NUEVO: Servicio de Secuenciación de Nueva Generación para la Gestión de brotes de HAI

bioMérieux EpiSeq es el NUEVO SERVICIO de bioMérieux para ayudarle a gestionar los brotes de infecciones asociadas con la atención sanitaria (HAI) utilizando la Secuenciación de Nueva Generación (NGS) con la tecnología de Illumina.

  • La experiencia de bioMérieux en microbiología y el know-how de Illumina en NGS para un servicio epidemiológico avanzado.
  • Acceda a un nivel superior de discriminación y caracterización de cepas a través de una secuenciación total del genoma.
  • Siga, contenga y prevenga la propagación de patógenos

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bioMérieux e Illumina: la asociación de la excelencia

bioMérieux EpiSeq es una colaboración diseñada para ofrecerle la excelencia en la que puede confiar para las soluciones de epidemiología. Une la experiencia de bioMérieux como pioneros en microbiología con el revolucionario conocimiento en genómica de Illumina.

Secuenciación de Nueva Generación: su nueva y potente solución contra HAI

Las Infecciones asociadas con la atención sanitaria (HAI), especialmente cuando se asocian con organismos resistentes antimicrobianos, son unas de las cargas sanitarias más estresantes de la actualidad, incurriendo en altos costes tanto en términos humanos y financieros (consulte la barra lateral). Cuanto más sabemos sobre los patógenos implicados en la transmisión de la infección o un brote, mejor podemos gestionarlos.

Ahora, bioMérieux, en colaboración con Illumina, le ofrece un nuevo servicio para el tipado genético de cepas basado en Secuenciación de Nueva Generación (NGS). El secuenciador de sobremesa Illumina MiSeq permite una secuenciación total del genoma para conseguir la mayor resolución posible y pruebas, libres de hipótesis, de genomas microbianos. El servicio de bioMérieux EpiSeq service ofrece por tanto un alto nivel de caracterización de la cepa bacteriana, dando información precisa sobre los patógenos sospechosos de transmisión de una infección o propagación de un brote de HAI. Esta potente herramienta permite a las instituciones y comunidades sanitarias:

  • Tomar decisiones dirigidas mejores y más rápidas

  • Implementar medidas de control de la infección

  • Dirigir una investigación epidemiológica mejorada

  • Reducir la incidencia de casos futuros

  • Reducir los costes de la gestión sanitaria relacionada con HAI

La carga de HAI - gestión y prevención

Las infecciones adquiridas en hospitales causan una significativa mortalidad y morbosidad en pacientes de todo el mundo: aproximadamente 100.000 muertes relacionadas cada año en Estados Unidos y Europa, y muchas más en países con menos recursos. También incurren en cargas sustanciales por los costes de la atención sanitaria, que se estiman en unos 7.000 millones de euros en Europa y en unos 6.500 millones de dólares en Estados Unidos cada año1.

Además de unas medidas preventivas, un control efectivo de la infección se consigue a través de una vigilancia activa de la infección además del reconocimiento e intervención de brotes de enfermedad que se presenten. Las investigaciones epidemiológicas moleculares se han vuelto cada vez más integrales con respecto a estas funciones, y se basan en una evaluación rápida y efectiva de la relación genética entre cepas2.

Organización Mundial de la Salud 2011. Report on the Burden of Endemic Health Care-Associated Infection Worldwide

2) Application of whole genome sequencing for bacterial strain typing in molecular epidemiology, Annals of Nigerian Medicine / Jul-Dec 2014 / Vol 8 | Issue 22015

bioMérieux EpiSeq: EL SERVICIO elegido para gestionar mejor los brotes nosocomiales utilizando NGS, Con la tecnología de Illumina™

Aproveche la potencia de NGS a través de EpiSeq de bioMérieux

El servicio EpiSeq de bioMérieux es la Secuenciación de Nueva Generación, más avanzada, con la tecnología de Illumina, accesible a todas las instituciones sanitarias y servicios de sanidad pública. Si se enfrenta a un posible brote de infección asociada con la atención sanitaria (HAI), el servicio EpiSeq de bioMérieux  le ofrece – en pocos y sencillos pasos – información crítica para gestionar mejor las HAI. Funciona así:

  1. Realice su pedido a bioMérieux
  2. Envíe su muestra a un laboratorio asociado designado
  3. Reciba sus resultados a través de acceso web seguro en pocos días
  4. Decida las acciones correctas a llevar a cabo

 

El Valor de la Secuenciación del Genoma Completo (WGS) en Microbiología Clínica

WGS ha demostrado ser inestimable para la detección y vigilancia de brotes. Se ha utilizado para definir las vías de transmisión de patógenos infecciosos y para apoyar las investigaciones de los brotes.
Secuenciar el genoma completo ofrece la última resolución para los estudios epidemiológicos, ya que permite ver cada región del genoma e identificar diferencias sutiles pasadas por alto por anteriores técnicas genotípicas3.

3) Bacterial whole genome sequencing: The future of clinical bacteriology, Annals of Nigerian Medicine / Jul-Dec 2014 / Vol 8 | Issue 2

¿Qué ocurre con su muestra?

Su muestra va a uno de nuestros laboratorios de secuenciación asociados utilizando la tecnología NGS con la tecnología del secuenciador de sobremesa Illumina MiSeq. El sistema MiSeq ofrece información de secuencia altamente precisa para la identificación del patógeno, subtipado y epidemiología. Las secuencias genéticas se analizan utilizando el software propietario de bioMérieux, así como su amplia base de datos genómicos, que contribuyen a crear una base de datos de un marco sin precedentes con información sobre las características de virulencia y resistencia microbiana de patógenos clave relacionados por lo general con las HAIs. Esto identifica el agente infeccioso y las variaciones genéticas basadas en la secuencia ayudan a contar la historia de su transmisión. Cuente con un análisis detallado de la información de secuenciación y una visualización interactiva de resultados comparativos. Un servidor en la nube optimiza las peticiones, la remisión de muestras y las comunicaciones. La certificación del laboratorio NGS además garantiza unos resultados y una comunicación estandarizados, y le ahorra tiempo y dinero frente a secuenciaciones “in house”.
 

Extracción de ADN  biblioteca de secuenciación    secuenciación  montaje  resultados
 

Con los resultados que incluyen MLST, Spa, Marcadores de resistencia, marcadores de virulencia y el árbol filogenético, consigue una imagen completa del agente causante, con ventajas como las siguientes:

  • Una resolución superior del tipado de cepa para una identificación precisa de las HAI. Menor probabilidad de resultados falsos positivos y falsos negativos.
  • Investigación epidemiológica al siguiente nivel: Permite la exploración de los genes virulentos de los aislados, los mecanismos de resistencia antibiótica, e investigación de epidemiología molecular .
  • Mejor comprensión de los eventos de transmisión: inferencia en alta resolución de relaciones filogenómicas y de la secuencia de los eventos de transmisión.
  • Capacidad sin precedentes para definir las relaciones de cepas para la investigación epidemiológica de brotes bacterianos, impactando de forma significativa en el control de la enfermedad para obtener unos mejores resultados en el paciente y controlar los costes
  • Página web de Illumina sobre la Secuenciación de Nueva Generación
  • Application of whole genome sequencing 1 for bacterial strain typing in molecular epidemiology.
  • JCM Accepted Manuscript Posted Online 28 January 2015
  • J. Clin. Microbiol. doi:10.1128/JCM.03385-14
  • Bacterial whole genome sequencing and clinical bacteriology - Annals of Nigerian Medicine / Jul-Dec 2014 / Vol 8 | Issue 2
  • Bacterial whole genome sequencing: The future of clinical bacteriology, Annals of Nigerian Medicine / Jul-Dec 2014 / Vol 8 | Issue 2

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